为了保证多模态医学图像的安全性，提出了一种基于遗传编码和耦合超混沌映射的多模态医学图像保护算法。在混沌序列生成阶段，提出了CMC-CTBCS耦合模型，以正弦映射(Sine)和无限折叠映射(ICMIC)作为种子映射，构建出三维Sine-ICMIC级联映射(3D-SICM)，并将其应用于多模态医学图像加密的设计。图像加密阶段主要包括三部分：多模态医学图像融合算法、基于边缘检测的零水印认证算法、遗传编码选择加密算法。首先，采用基于相位一致性和局部拉普拉斯能量的NSCT域多模态医学图像融合方案，对磁共振成像(MRI)和单光子发射计算机断层成像(SPECT)进行融合，并在融合过程中实现基于边缘检测的零水印信息认证，进而生成融合后的标记图像，然后采用基于动态DNA编码和6比特RNA-S盒替换的选择性加密方案对标记图像进行加密。理论分析和数值模拟表明，该算法具有良好的安全性。